Για χρόνια, οι επιστήμονες συζητούσαν αν οι καρκίνοι περιέχουν το δικό τους μικροβίωμα – κοινότητες βακτηρίων, ιών και μυκήτων που ζουν μέσα στους όγκους. Το πεδίο έχει δώσει αντικρουόμενα αποτελέσματα, καθώς οι διαφορετικές ερευνητικές μέθοδοι και οι ανησυχίες σχετικά με την επιμόλυνση δυσκόλευαν τον προσδιορισμό του ποιες διαπιστώσεις είναι αξιόπιστες.
Ογκολόγοι προειδοποιούν: Πετάξτε αυτά τα καλλυντικά – Πώς συνδέονται με τον καρκίνο
Νέα μελέτη αποκαλύπτει ποιοι καρκίνοι έχουν το δικό τους μικροβίωμα – Πώς μπορεί να αλλάξει η διάγνωση και η θεραπεία
«Η ομάδα μας επιδίωξε να δώσει οριστική απάντηση στο ερώτημα, χρησιμοποιώντας τη μεγαλύτερη συλλογή γενετικών δεδομένων καρκίνου στον κόσμο – το 100,000 Genomes Project της Genomics England, το οποίο περιλαμβάνει DNA από πάνω από 16.000 όγκους», εξηγούν οι Henry Wood, Λέκτορας στη Μεταφραστική Βιοπληροφορική στο University of Leeds, και Anders Dohlman, Ερευνητικός συνεργάτης στον τομέα της Ιατρικής στο Harvard University, σύμφωνα με το Conversation.
Η ανάλυσή τους διαπίστωσε ότι οι περισσότεροι καρκίνοι, συμπεριλαμβανομένων των όγκων του εγκεφάλου, του μαστού και των νεφρών, δεν παρουσίαζαν διακριτό μικροβίωμα. Αντίθετα, οι καρκίνοι του στόματος, του οισοφάγου, του στομάχου και του εντέρου περιείχαν σαφείς ενδείξεις παρουσίας βακτηρίων, ιών, μυκήτων, αρχαίων μικροοργανισμών (archaea) και, σε ορισμένες περιπτώσεις, του παρασίτου Trichomonas.
Ποια είναι η σχέση μεταξύ των καρκινικών όγκων και των μικροβίων
Πολλοί όγκοι δεν είναι αποστειρωμένοι. Η έρευνα δείχνει ότι οι καρκίνοι μπορούν να περιέχουν τις δικές τους κοινότητες βακτηρίων, μυκήτων, ιών και άλλων μικροοργανισμών, γνωστές ως μικροβίωμα του όγκου.
Αυτά τα μικρόβια μπορεί να επηρεάζουν τον τρόπο με τον οποίο αναπτύσσεται και εξαπλώνεται ο καρκίνος, πώς αλληλεπιδρά με το ανοσοποιητικό σύστημα και πώς ανταποκρίνεται στη θεραπεία. Οι επιστήμονες θεωρούν πλέον το μικροβίωμα σημαντικό μέρος της βιολογίας του καρκίνου και όχι έναν παθητικό παρατηρητή.
ΠΟΥ: 1 στους 5 θα εμφανίσει καρκίνο στη ζωή του- Σχεδόν 35 εκατομμύρια νέες διαγνώσεις έως το 2050
- Οι όγκοι μπορούν να περιέχουν διακριτές μικροβιακές κοινότητες, με διαφορετικούς τύπους καρκίνου να εμφανίζουν διαφορετικές μικροβιακές «υπογραφές», σύμφωνα με δημοσίευση του 2026 με τίτλο “The microbial conductor of cancer hallmarks: intratumoral microbiome as a multidimensional oncogenic modulator”.
- Ορισμένα μικρόβια μπορεί να συμβάλλουν στην ανάπτυξη του καρκίνου προκαλώντας βλάβες στο DNA ή προάγοντας τη φλεγμονή.
- Τα μικρόβια των όγκων μπορούν να επηρεάσουν τις ανοσολογικές αποκρίσεις, είτε βοηθώντας τον οργανισμό να καταπολεμήσει τον καρκίνο είτε βοηθώντας τους όγκους να αποφεύγουν την ανίχνευση.
- Το μικροβίωμα του εντέρου και των όγκων μπορεί να επηρεάζει το πόσο αποτελεσματικά λειτουργούν οι θεραπείες κατά του καρκίνου, συμπεριλαμβανομένης της ανοσοθεραπείας.
Πώς κατάφεραν οι ερευνητές να απομονώσουν τα μικρόβια – Τι μπορεί να σημαίνει για διάγνωση και θεραπεία
Μία από τις μεγαλύτερες προκλήσεις που αντιμετώπισαν οι ερευνητές ήταν να καθορίσουν αν τα μικροβιακά σήματα που εντοπίστηκαν στα δείγματα όγκων ήταν γνήσια ή απλώς αποτέλεσμα εργαστηριακής επιμόλυνσης. Η αλληλούχηση ενός όγκου καταγράφει όλο το DNA που υπάρχει σε ένα δείγμα, συμπεριλαμβανομένου τόσο του ανθρώπινου όσο και του μη ανθρώπινου γενετικού υλικού.
Ενώ οι περισσότερες μελέτες για τον καρκίνο εστιάζουν μόνο στο ανθρώπινο DNA, οι Henry Wood και Anders Dohlman εξηγούν ότι έκαναν το αντίθετο. «Απορρίψαμε το ανθρώπινο DNA και συγκρίναμε ό,τι απέμενε με γνωστά μικροβιακά γονιδιώματα για να δούμε τι κρυβόταν εκεί», είπαν.
Η διαδικασία ήταν περίπλοκη. Το ανθρώπινο DNA διαφέρει από άτομο σε άτομο και τα γονιδιώματα αναφοράς περιέχουν κενά, γεγονός που σημαίνει ότι ορισμένο ανθρώπινο γενετικό υλικό μπορεί λανθασμένα να ταυτοποιηθεί ως μικροβιακό. Οι ερευνητές έπρεπε επίσης να λάβουν υπόψη σφάλματα στις μικροβιακές βάσεις δεδομένων και επιμόλυνση που εισάγεται κατά την προετοιμασία των δειγμάτων.
Για να μειώσει αυτούς τους κινδύνους, η ομάδα φιλτράρισε τα δεδομένα χρησιμοποιώντας πολλαπλές εκδόσεις του ανθρώπινου γονιδιώματος, αφαίρεσε αμφίσημες αλληλουχίες και χρησιμοποίησε ενημερωμένα εργαλεία αντιστοίχισης DNA με προσεκτικά επιμελημένες μικροβιακές βάσεις δεδομένων.
Παράλληλα, συνέκρινε τα μικροβιακά πρότυπα μεταξύ διαφορετικών τύπων καρκίνου. Τα είδη που εντοπίζονταν σχεδόν σε κάθε καρκίνο θεωρήθηκαν πιθανές επιμολύνσεις, ενώ εκείνα που περιορίζονταν σε συγκεκριμένους καρκίνους ήταν πιο πιθανό να είναι γνήσια. Αρκετά μικρόβια που αφαιρέθηκαν από την ανάλυση αποδείχθηκε ότι ήταν κοινά βακτήρια του δέρματος, τα οποία πιθανότατα εισήχθησαν κατά τη διαχείριση των δειγμάτων.
«Έχουμε διαθέσει πλέον τα δεδομένα μας δωρεάν ως λογισμικό που μπορεί να μεταφορτωθεί», αναφέρουν οι ερευνητές, επιτρέποντας έτσι σε άλλους να χρησιμοποιήσουν τις ίδιες αυστηρές μεθόδους.
Ελπίζουν ότι αυτή η εργασία θα βοηθήσει στην επίλυση ετών αντικρουόμενων ευρημάτων και θα επιτρέψει στους επιστήμονες να επικεντρωθούν στο πώς οι μικροβιακές κοινότητες στους καρκίνους του πεπτικού συστήματος μπορεί να επηρεάζουν την ανάπτυξη των όγκων, την ανταπόκριση στη θεραπεία και, τελικά, την έγκαιρη διάγνωση και φροντίδα.
Πηγές: Conversation, Frontiers, Springer, PMC, NPJ